银行存款的审计是财务报表审计中的重要部分，其主要目标在于验证企业银行存款的真实性、完整性和准确性。在进行银行存款的实质性程序时，主要包括以下几方面的

1. 获取并核对银行对账单：注册会计师需要从被审计单位获取银行对账单，并与企业的银行存款日记账进行逐笔核对，确保每一笔交易都有记录且无遗漏。

2. 函证银行存款余额：向银行发出函证，确认企业银行存款账户的期末余额是否真实存在，同时检查是否存在未披露的抵押或冻结等限制性条件。

3. 检查未达账项：分析企业银行存款日记账和银行对账单中存在差异的原因，如未达账项，确保所有未达账项均已合理解释并记录。

4. 审查银行存款收支凭证：抽查一定数量的银行存款收支凭证，验证其真实性、合法性和完整性，确保每笔交易均有合法的原始凭证支持。

5. 评估内部控制：了解并测试与银行存款相关的内部控制制度，判断其设计和执行的有效性，从而进一步确认银行存款的真实性和准确性。

6. 分析银行存款异常变动：对银行存款余额的异常变动进行分析，查找原因，评估企业是否存在资金管理不当或潜在的舞弊风险。

以上就是银行存款的主要实质性程序，其中并不包括“评估企业盈利能力”。因为盈利能力的评估属于经营成果的审计范畴，而非直接针对银行存款的真实性、完整性和准确性进行验证。