花呗收款手续费扣除由商家承担，费率与商家类别有关：

1.线下商家。花呗收钱的手续费费率为0.8%。1000元花呗收款，手续费为8元。

2.天猫商家。花呗收款收续费费率为0.8%，并在消费者购物确认收货后，由支付系统自动进行扣除。也就是1000元花呗收款，手续费为8元。

3.淘宝商家。花呗收款收续费费率为1%，相较之下略高一些。也就是1000元花呗收款，手续费为10元。