目前对于U盘来说，格式化的时候主要有三个文件系统选项，分别是FAT16 FAT32 NTFS ExFAT，各种文件系统格式有不同的优缺点，具体如下：

FAT16格式主要优点是兼容性最好，由于目前有些电子产品对FAT32和NTFS格式的存储卡或是手机U盘支持不太好，而只能选择FAT16。缺点也很明显最大仅支持2GB分区，空间浪费大。FAT32格式兼容性比较好。缺点更大一些单个文件不能超过4GB，不支持512MB以下容量的U盘。目前很多的U盘采用的都是这种文件系统，拷贝4GB文件的时候会失败，此时换用NTFS或ExFAT格式就可以了。

NTFS格式也是兼容性不错的一种格式，支持任意大小的U盘。但是使用时间比较长的话会缩短闪存寿命，不过U盘很便宜，坏了完全可以购买新的。ExFAT格式专为闪存和U盘设计，空间浪费小，但是目前兼容性差，XP和vista系统需要更新补丁才能支持。

你的需求是使用大容量的U盘做移动系统U盘，这样的话建议选择NTFS格式激活U盘分区，这样的话可以直接使用官方的WIndows to go软件直接写入镜像就可以了。

就现在而言。只有两种适合的分区，一个是FAT32，一个是NTFS。FAT32分区单个文件不能超过4GB容量。也就是说，装不了一个高清电影。NTFS就没有这方面的问题，单个文件多大都行。至于FAT16和EXFAT格式，早就被淘汰了。基本不使用